学校高度重视创新创业教育，建成了以“晨光创业园”“筑梦创客园”等为主体、总面积达4万余平方米的校内大学生双创园区；涌现出了以卜贤超、菅保森、王翡翠、宋雄、张培文等为代表的创新创业先进典型，形成了“全覆盖、全过程、全方位”双创教育模式和以“自强自立、创新创业”为核心的双创教育文化品牌。在教育部组织开展的“全国高校实践育人创新创业基地”（首批）、“全国深化创新创业教育改革示范高校”（首批）、“全国创新创业典型经验高校”评选中，武汉生物工程学院实现了这三项荣誉的“大满贯”（同期全国仅有28所高校获得，武汉生物工程学院为全国同类院校唯一）；学校还获批为湖北省人民政府“大众创业万众创新示范基地”（首批）；连续多次获批湖北省人力资源和社会保障厅“大学生创业孵化示范基地”、湖北省教育厅“大学生创业示范基地”；长河筑梦众创空间被科技部火炬中心备案为“国家级众创空间”。